甲公司系增值税一般纳税人，2022年了月发生下列两笔业务:业务1:2022年7月1日，将持有的乙上市公司股权全部转让，取得转让收入1060万元，经审核发现,甲公司在向乙公司投资时支付款项954万元。业务2:2022年7月10日，将持有的丙未上市中小型科技公司股权全部转让，取得转让收入100万元，经审核发现，甲公司在向丙公司投资时支付款项90万元。

要求:作为甲公司的常年税务顾问，请您回答甲公司财务人员咨询的下列问题。