1.A市⽔天公司与B市龙江公司签订⼀份运输合同，并约定如发⽣争议提交A市的C仲裁委员会仲裁。后因⽔天公司未按约⽀付运费，龙江公司向C仲裁委员会申请仲裁。在第⼀次开庭时，⽔天公司未出庭参加仲裁审理，⽽是在开庭审理后的第⼆天向A市中级⼈民法院申请确认仲裁协议⽆效。C仲裁委员会应当如何处理本案？